Depuis leur développement jusqu’à un âge avancé, la plupart des organismes connaissent un déclin progressif de leurs capacités de régénération. Chaque organe associe un compartiment fonctionnel, le parenchyme, et un compartiment stromal qui soutient son activité. Dans ce stroma résident les cellules stromales mésenchymateuses (MSCs), capables de multiples différenciations et considérées comme des acteurs clés de la réparation tissulaire.
Le tissu adipeux est aujourd’hui le réservoir le plus riche en MSCs, appelées cellules stromales adipeuses (ASCs). De façon inattendue, ce réservoir peut être mobilisé en réponse à un stress à distance d’origine inflammatoire ou lésionnel : une fois libérées, les ASCs infiltrent l’organe lésé et participent à son remodelage et à sa régénération. Le projet STROMAGICS s’appuie sur nos travaux récents pour comprendre comment cette dynamique contribue à la santé musculaire et comment elle évolue avec l’âge. Notre hypothèse centrale est que les ASCs, au-delà de leur rôle local dans la réparation musculaire, agissent comme de véritables régulateurs systémiques de la communication inter-organes, offrant de nouvelles opportunités thérapeutiques face au déclin lié au vieillissement.
Notre programme scientifique s’articule autour de quatre piliers complémentaires :
IDENTIFIER : Décoder les signatures cellulaires et tissulaires de la santé musculaire
→ Construire une carte moléculaire des sous-types d’ASCs et de leur microenvironnement, en combinant transcriptomique spatiale, profilage fonctionnel et imagerie multispectrale de fascia, tissu adipeux et muscle, chez la souris et chez l’humain.PRÉDIRE : Modéliser les trajectoires de santé musculaire grâce à l’IA
→ Développer des modèles prédictifs robustes et interprétables pour anticiper les premiers signes de déclin musculaire, en s’appuyant sur l’intelligence artificielle auto-supervisée et des approches mathématiques de confiance.RETARDER : Développer des stratégies ciblées pour ralentir le déclin musculaire
→ Restaurer la capacité migratoire et régénérative des ASCs vieillissantes (ex. ciblage de MMP3) et explorer comment la modulation de la composition du fascia peut favoriser la régénération.ÉTENDRE : Explorer la dynamique des ASCs au-delà du muscle
→ Utiliser la drosophile comme modèle pour analyser les mécanismes fondamentaux et conservés de plasticité stromale, de communication inter-organes et de résilience au cours du vieillissement.
Mécanismes moléculaires et cellulaires contrôlant la dynamique des ASCs en réponse à un stress tissulaire à distance
Nous analysons l’hétérogénéité des ASCs sur les paramètres de motilité, de capacité de différenciation et de profil métabolomique.
Comment les ASCs circulent-elles entre les organes en réponse à un stress tissulaire à distance ?
Nous cherchons à comprendre quelles sont les voies de mobilisation qui sont empruntées par les ASCs pour circuler et les mécanismes moléculaires et cellulaires qu’elles utilisent pour naviguer entre les organes. En particulier la voie sanguine et les fascia. Nous explorons par ailleurs le contrôle de cette dynamique exercée par le système nerveux.
Déclin fonctionnel et analyse de la dynamique des ASCs
Dans cette partie du projet STROMAGICS, nous cherchons à savoir si le déclin fonctionnel est associé à une modification du dialogue inter-organes en réponse aux lésions tissulaires dans des modèles animaux et chez l’homme.
Coralie Sengenès
Group Leader - PhD DR INSERM
Jean-Louis Frendo
Co-Group Leader - PhD - CR CNRS
Mireille André
AI CNRS
Corinne Barreau
PhD - IE UPS-UT3
Muriel Boube-Trey
PhD - CR CNRS
Pascal Cintas
PH
Xavier Contreras
PhD - CR Inserm
Cécile Dromard Berthezene
PhD - MCF UPS-UT3
Laurence Dubois
PhD - CR CNRS
Amandine Girousse
DVM PhD - CR CNRS
Elena Griseti
PhD-MCF UPS-UT3-Pharmacie
Géraldine Jourdan
MCU-PH ENVT
Sylvie Monferran
PhD - MCF UPS-UT3 Pharmacie
Arthur Chiron
PhD Student - Codirection IRIT/ANITI
Emma Grandgirard
PhD Student - Codirection IRIT/ANITI
Margaux Labrosse
PhD Student
Pauline Lombardo
PhD Student - Codirection ISAE SupAéro
Les News !!
Articles Scientifiques
Articles Cliniques
Revues
Les News !!
BRAVO à Margaux LABROSSE notre nouvelle Docteur !!!
BRAVO à Elena GRISETI, notre nouvelle Maitresse de Conférences !!!
Nos derniers preprints !
1. Mobilizable adipose stromal cells fuel regenerative adipogenesis in injured muscle. Margaux Labrosse, Maxime Mathieu, Laura Le Pelletier, Virginie Bourlier, Corinne Barreau, Mireille André, Emmanuelle Arnaud, Cédric Moro, Coralie Sengenès, Amandine Girousse, Xavier Contreras. bioRxiv 2025.09.23.678035
2. NucGen3D: a Synthetic Framework for Large-Scale 3D Nuclear Segmentation with Open-Source Training Data AND Models. Emma Grandgirard, Théotime Dmitrašinović, Corinne Barreau, Coralie Sengenès, Mathieu Serrurier. bioRxiv 2025.10.08.681092
Articles Scientifiques
Scientific Articles
2025
- Pelletier A, Carayon A, Carrier Y, Sengenès C, Dubois L, Frendo JL. Multiple cis-regulatory modules ensure robust tup/islet1 function in dorsal muscle identity specification. Skelet Muscle. 2025 Aug 25;15(1):23. doi: 10.1186/s13395-025-00392-4. PMID: 40855345; PMCID: PMC12376424.
- Baz MH, Valette M, André M, Varin A, Trevisiol E, Sengenès C, Gue AM. Isolation of adipose stromal cells from blood using a two-step microfluidic platform ASCfinder. Sci Rep. 2025 Mar 26;15(1):10471. doi: 10.1038/s41598-025-94353-y. PMID: 40140537; PMCID: PMC11947280.
2024
- Griseti E, Bello AA, Bieth E, Sabbagh B, Iacovoni JS, Bigay J, Laurell H, Čopič A. Molecular mechanisms of perilipin protein function in lipid droplet metabolism. FEBS Lett. 2024 May;598(10):1170-1198. doi: 10.1002/1873-3468.14792.
- Mogicato G, Cavalerie R, Daniels-Treffandier H, Cartiaux B, Montel C, Verwaerde P, Jourdan G. Morphological comparative study of canine and feline diaphragms: Effect of bodyweight, body condition score, gender, age and breed. Anat Histol Embryol. 2024 May;53(3):e13039. doi: 10.1111/ahe.13039.
- Manteaux G, Amsel A, Riquier-Morcant B, Prieto Romero J, Gayte L, Fourneaux B, Larroque M, Gruel N, Quignot C, Perot G, Jacq S, Cisse MY, Pomiès P, Sengenes C, Chibon F, Heuillet M, Bellvert F, Watson S, Carrere S, Firmin N, Riscal R, Linares LK. A metabolic crosstalk between liposarcoma and muscle sustains tumor growth. Nat Commun. 2024 Sep 12;15(1):7940. doi: 10.1038/s41467-024-51827-3.
2023
- Sastourné-Arrey Q*, Mathieu M*, Contreras X, Monferran S, Bourlier V, Gil-Ortega M, Murphy E, Laurens C, Varin A, Guissard C, Barreau C, André M, Juin N, Marquès M, Chaput B, Moro C, O’Gorman D, Casteilla L, Girousse A*, Sengenès C*. Adipose tissue is a source of regenerative cells that augment the repair of skeletal muscle after injury. Nat Commun. 2023 Jan 5;14(1):80. doi: 10.1038/s41467-022-35524-7.
- Markus D, Pelletier A, Boube M, Port F, Boutros M, Payre F, Obermayer B, Zanet J. The pleiotropic functions of Pri smORF peptides synchronize leg development regulators. PLoS Genet. 2023 Oct 30;19(10):e1011004. doi: 10.1371/journal.pgen.1011004.
- Contreras X, Depierre D, Akkawi C, Srbic M, Helsmoortel M, Nogaret M, LeHars M, Salifou K, Heurteau A, Cuvier O, Kiernan R. PAPγ associates with PAXT nuclear exosome to control the abundance of PROMPT ncRNAs. Nat Commun. 2023 Oct 24;14(1):6745. doi: 10.1038/s41467-023-42620-9.
- Cardona A, Ecsedi S, Khier M, Yi Z, Bahri A, Ouertani A, Valero F, Labrosse M, Rouquet S, Robert S, Loubat A, Adekunle D, Hubstenberger A. Self-demixing of mRNA copies buffers mRNA:mRNA and mRNA:regulator stoichiometries. Cell. 2023 Sep 28;186(20):4310-4324.e23. doi: 10.1016/j.cell.2023.08.018.
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- Bourgeois C, Gorwood J, Olivo A, Le Pelletier L, Capeau J, Lambotte O, Béréziat V, Lagathu C. Contribution of Adipose Tissue to the Chronic Immune Activation and Inflammation Associated With HIV Infection and Its Treatment. Front Immunol. 2021 Jun 18;12:670566. doi: 10.3389/fimmu.2021.670566.
- Sapaly D, Cheguillaume F, Weill L, Clerc Z, Biondi O, Bendris S, Buon C, Slika R, Piller E, Sundaram VK, da Silva Ramos A, Amador MDM, Lenglet T, Debs R, Le Forestier N, Pradat PF, Salachas F, Lacomblez L, Hesters A, Borderie D, Devos D, Desnuelle C, Rolland AS, Periou B, Vasseur S, Chapart M, Le Ber I, Fauret-Amsellem AL, Millecamps S, Maisonobe T, Leonard-Louis S, Behin A, Authier FJ, Evangelista T, Charbonnier F, Bruneteau G; PULSE study group. Dysregulation of muscle cholesterol transport in amyotrophic lateral sclerosis. Brain. 2024 Aug 28:awae270. doi: 10.1093/brain/awae270. Online ahead of print. PMID: 39197036
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- Onnée M, Bénézit A, Bastu S, Nadaj-Pakleza A, Lannes B, Ader F, Thèze C, Cintas P, Cances C, Carlier RY, Metay C, Cossée M, Malfatti E. The FLNC Ala1186Val Variant Linked to Cytoplasmic Body Myopathy and Cardiomyopathy Causes Protein Instability. Biomedicines. 2024 Jan 30;12(2):322. doi: 10.3390/biomedicines12020322. PMID: 38397924
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2021
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Articles Cliniques
Clinical Articles
2024
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- Gérard L, Delourme M, Tardy C, Ganne B, Perrin P, Chaix C, Trani JP, Eudes N, Laberthonnière C, Bertaux K, Missirian C, Bassez G, Behin A, Cintas P, Cluse F, De La Cruz E, Delmont E, Evangelista T, Fradin M, Hadouiri N, Kouton L, Laforêt P, Lefeuvre C, Magot A, Manel V, Nectoux J, Pegat A, Sole G, Spinazzi M, Stojkovic T, Svahn J, Tard C, Thauvin C, Verebi C, Salort Campana E, Attarian S, Nguyen K, Badache A, Bernard R, Magdinier F. SMCHD1 genetic variants in type 2 facioscapulohumeral dystrophy and challenges in predicting pathogenicity and disease penetrance. Eur J Hum Genet. 2024 Dec 26. doi: 10.1038/s41431-024-01781-x. Online ahead of print. PMID: 39725690
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- Theuriet J, Masingue M, Behin A, Ferreiro A, Bassez G, Jaubert P, Tarabay O, Fer F, Pegat A, Bouhour F, Svahn J, Petiot P, Jomir L, Chauplannaz G, Cornut-Chauvinc C, Manel V, Salort-Campana E, Attarian S, Fortanier E, Verschueren A, Kouton L, Camdessanché JP, Tard C, Magot A, Péréon Y, Noury JB, Minot-Myhie MC, Perie M, Taithe F, Farhat Y, Millet AL, Cintas P, Solé G, Spinazzi M, Esselin F, Renard D, Sacconi S, Ezaru A, Malfatti E, Mallaret M, Magy L, Diab E, Merle P, Michaud M, Fournier M, Pakleza AN, Chanson JB, Lefeuvre C, Laforet P, Richard P, Sternberg D, Villar-Quiles RN, Stojkovic T, Eymard B. Congenital myasthenic syndromes in adults: clinical features, diagnosis and long-term prognosis. Brain. 2024 Nov 4;147(11):3849-3862. doi: 10.1093/brain/awae124. PMID: 38696726
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- Retailleau E, Lefeuvre C, De Antonio M, Bouhour F, Tard C, Salort-Campana E, Lagrange E, Béhin A, Solé G, Noury JB, Sacconi S, Magot A, Pakleza AN, Orlikowski D, Beltran S, Spinazzi M, Cintas P, Fournier M, Bouibede F, Prigent H, Nicolas G, Taouagh N, El Guizani T, Attarian S, Arrassi A, Hamroun D, Laforêt P. Bulbar muscle impairment in patients with late onset Pompe disease: Insight from the French Pompe registry. Eur J Neurol. 2024 Oct;31(10):e16428. doi: 10.1111/ene.16428. Epub 2024 Aug 7. PMID: 39109844
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