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Génomique & Transcriptomique

Notre plateforme est spécialisée dans l’étude du génome et du transcriptome et offre différents types de prestations aux équipes de recherche.

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Le CERT a développé une solide expertise dans les puces à ADN, la PCR en temps réel à haut débit et le séquençage "nouvelle génération", y compris sur cellules uniques. Les équipements suivants sont accessibles afin de réaliser des mesures d’expression de gènes :

Équipements pour la qualification et quantification des échantillons d’acides nucléiques

  • Spectrophotométrie: Nanodrop 2000
    Spectrofluorimétrie (QuBit 4.0 ThermoFisher Scientific) disponible sur le plateau du CRCT
  • Electrophorèse microfluidique (Fragment Analyser) disponible sur le plateau du CRCT

Équipements de transcriptomique

  • PCR quantitative
    • CFX96® ( 96 puits)-Biorad
    • StepOne (96 puits)-Applied
    • 2x LC480 (384 puits)-Roche
  • Biopuces à ADN
    • Station GeneAtlas Affymetrix
    • Système de NanoString
    • nCounter Analysis System. Utilise des codes barres moléculaires pour détecter et compter des centaines de transcrits uniques (sans amplification).

La réalisation des projets NGS pourra se faire avec le plateau du CRCT.

Les conditions d’accès sont les suivantes :
Avoir pris contact avec le responsable Transcriptomique Avoir reçu une formation sur les instruments et techniques envisagés Avoir réservé les instruments sur le planning de réservation en ligne

Nous vous proposons conseils et accompagnement pour choisir, adapter, réaliser :

  • La construction de biomarqueurs, biosenseurs et rapporteurs fluorescents,
  • l’édition de génome pour modifier les lignées cellulaires ou le petit animal,
  • la validation des constructions réalisées, selon les techniques appropriées d’imagerie, biologie cellulaire, ou biochimie .

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Emmanuelle Arnaud

Ingénieure transcriptomique

Odile Mondésert

Ingénieure génomique

Les ingénieures de la plateforme évaluent la demande de l’utilisateur et proposent la solution la plus adaptée à ses besoins en :

  • assurant le conseil dans l’élaboration des manipulations,
  • formant les utilisateurs,
  • assistant les utilisateurs dans l’analyse et l’interprétation de leurs résultats,
  • accompagnant les utilisateurs dans la mise en place de projet de recherche et développement, sous forme de collaboration.
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