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Génomique & Transcriptomique

Notre plateau accompagne les équipes de RESTORE dans la réalisation et l'analyse de leurs projets d'étude du transcriptome reposant sur des approches de bas/moyen/haut débit ( qPCR, NGS).

  • Training on qPCR instruments
  • Setting up an experimental protocol
  • Analysis and interpretation of results
  • Use of a 384-well plate dispenser

» Nucleic acid quality control

» Projects bulk RNA 

  • Upstream of sequencing: experimental design, RNA quality control, library construction
  • Interface with sequencing platforms
  • Downstream: bioinformatics analyses (quality control, alignment, differential analyses)

» Projects SingleCell RNAseq

  • Quantitative PCR instruments
    • QS5 (384 wells) – Applied
    • LC480 (384 wells) – Roche
    • StepOne (96 wells) – Applied
    • CFX96 (96 wells) – Biorad
  • Pipetting device
    • epMotion 5075 Eppendorf

CONTACT

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Emmanuelle Arnaud

Responsable transcriptomique
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Karine Fata

Technicienne - UPS-UT3
Equipements
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