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Génomique & Transcriptomique

Notre plateau accompagne les équipes de RESTORE dans la réalisation et l'analyse de leurs projets d'étude du transcriptome reposant sur des approches de bas/moyen/haut débit ( qPCR, NGS).

  • Formation sur les instruments de qPCR (en libre accès)
  • Mise en place d’un protocole expérimental
  • Analyse et interprétation des résultats
  • Utilisation d’un automate de distribution plaque 384 puits

» Contrôle qualité des acides nucléiques

» Projets bulk RNA 

  • En amont du séquençage: plan expérimental, contrôle qualité des ARN, réalisation des librairies
  • Interface avec les plateformes de séquençage
  • En aval : analyses bio info (contrôle qualité, alignement, analyses différentielles)

» Projets SingleCell RNAseq

  • Instruments de PCR quantitative
    • QS5 (384 puits) – Applied
    • LC480 (384 puits) – Roche
    • StepOne (96 puits) – Applied
    • CFX96 (96 puits) – Biorad
  • Automate de pipetage
    • epMotion 5075 Eppendorf

CONTACT

emmanuelle arnaud

Emmanuelle Arnaud

Responsable transcriptomique

Karine Fata

Technicienne - UPS-UT3
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