23/09 : LE 13H DE LAURENT ALRIC @ RESTORE

Interactions entre malades, services cliniques et laboratoires de recherche

Les interactions entre les malades, les services cliniques du CHU et les laboratoires de recherche sont nécessaires.

Elles peuvent passer par la mise à disposition d’échantillons issus de malades ou des innovations thérapeutiques.

Il sera donné des exemples comme la constitution d’une bio banque, la genèse d’un protocole de traitement par thérapie cellulaire régénérative et les perspectives de la transplantation de microbiote fécal.

Pour en apprendre davantage

Pr Laurent ALRIC

Chef de service, PU-PH,

Médecine interne et immunologie clinique

RESTORE équipe 2 “Flames”

Offre d’emploi Ingénieur.e Bioinformaticien.ne

National Cancer Institute - Unsplash

Ingénieur.e Bioinformaticien.ne : Projet INSPIRE

Ville : Toulouse, France

Corps : Ingénieur.e Bioinformaticien.ne

Remunération : 2403,93 brut mensuel mini.

Type de contrat : CDD / Contrat doctoral 8 mois à partir de janvier 2022

Quote : Temps complet

Description du poste

Mission :

La personne recrutée participera au sein de l’unité au projet structurant INSPIRE qui a pour
objectif de mieux comprendre les processus biologiques du vieillissement et ainsi définir un âge
physiologique au-delà du simple âge civil ou chronologique et l’identification de biomarqueurs du
vieillissement. Sa mission sera de concevoir et d’organiser la collecte et le traitement de données
sous la responsabilité d’un référent scientifique.


Activités principales :


• Définir le plan d’étude et de recueil des données le mieux adapté au problème posé
• Concevoir et élaborer la structure de bases de données et de systèmes d’information
permettant de collecter, structurer, stocker et mettre en relation les données hétérogènes
(numériques, image …)
• Concevoir les modèles mathématiques /informatiques adaptés
• Orienter et conseiller les utilisateurs pour la mise en oeuvre des méthodes d’études et
d’interprétation des résultats
• Analyser les données issues de travaux de recherche expérimentale et clinique
• Diffuser et valoriser les résultats et réalisations technologiques sous forme de rapports,
brevets, publications, présentations orales
• Gérer les moyens humains, techniques et financiers alloués aux dispositifs de collecte et
de traitement de données
• Former, en interne et en externe, aux principes et à la mise en oeuvre des techniques de
l’analyse des données biologiques
• Assurer et organiser la veille scientifique et technologique dans son domaine d’activité

Contexte de travail

Connaissances :

• Recueil, analyse et traitement des données (connaissance approfondie) Informatique
appliquée (connaissance approfondie) : Programmation R, Python, SQL
• Bioinformatique : Analyse de séquences, annotations taxonomiques et fonctionnelles,
interprétation de données de masse…
• Statistiques : Description et visualisation des données, tests pairés, modèles mixtes,
modèles linéaires, ANOVA, ACP, clustering…
• Des connaissances en machine learning seraient appréciées pour le traitement de
données hétérogènes (SVM, random forest, réseaux convolutionnels …)
• Cadre légal et déontologique
• Langue anglaise : B2 à C1 (cadre européen commun de référence pour les langues)

Savoir-faire :

• Concevoir un plan d’échantillonnage
• Organiser et manipuler de grandes bases de données
• Garantir la qualité et la pertinence des outils d’analyse et des résultats
• Concevoir des outils d’analyse ouverts et pédagogiques

Aptitudes :

• Interactions indispensables avec l’ensemble des interlocuteurs
• Autonomie
• Esprit d’équipe
• Rigueur
• Excellent relationnel
• Leadership

Informations complémentaires

Date de prise de fonction Janvier 2022 Durée 8 mois


Temps de travail : 

Temps plein
38.30 heures hebdomadaires

32 jours de Congés Annuels et 13 jours de RTT

Rémunération :

A partir de 2403,93 bruts mensuels en fonction de l’expérience professionnelle sur des postes de niveau
équivalent.

CONTACT

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