The team Dr MAHÉ leads tries to create integrated human gut models derived from human pluripotent stem cells. His group uses these models with complex environmental cues, including mechanics and luminal factors (microbiota, nutrients). His group builds on these models to elucidate novel functions and mechanisms of the enteric nervous system (ENS) in regulating intestinal development and niche formation. 

Les travaux de recherche de l’équipe du Dr WAI visent à mieux comprendre l’interaction complexe de la dynamique et du métabolisme des mitochondries dans la santé et la maladie. 

Sa recherche s’appuie sur une science de pointe dans les domaines de la biologie cellulaire et de la biochimie des mitochondries. Son équipe applique ses connaissances à des modèles animaux précliniques et à des modèles cellulaires dérivés de biopsies de patients afin de combler les lacunes fondamentales en matière de connaissances translationnelles dans les maladies génétiques rares du métabolisme ainsi que dans les maladies courantes associées à l’âge, notamment les maladies cardiovasculaires, le cancer et la neurodégénérescence.

Macrophages are innate immune cells that migrate and are present in all tissues to maintain the immune surveillance. They are targets for pathogens and ingest particles such as bacteria or dead cells, a process called phagocytosis. Our team focuses on the mechanisms used by macrophages to interact with their environments, in order to reveal molecules that could be usefully targeted to limit their deleterious action. (cf. team description on their website)

Le laboratoire des IMRCP est une unité étudiant l’organisation de molécules (tensioactifs, lipides…), de nanoparticules (organiques ou inorganique) et de polymères (naturels ou non), en solution mais aussi en masse.

Cette organisation est responsable de multiples propriétés et applications tant en biologie et médecine (agents de contraste, transport et relargages de composés bioactifs, matériaux biocompatibles…), qu’en science des matériaux (capteurs, aéronautique…), ou en environnement (procédés verts, analyse de polluants…).

Leurs compétences larges qui vont de la synthèse de ces molécules ou polymères à la caractérisation de ces organisations et propriétés permettent au laboratoire de répondre à de nombreux questionnements scientifiques dans des thématiques extrêmement variées.

Ainsi, depuis de nombreuses années, leurs collaborations en pharmacologie, biologie et médecine ont été extrêmement fructueuses et enrichissantes. Favoriser de nouveaux liens et travaux dans ces domaines est une priorité du laboratoire.

To improve their adaptation to the changing environment presents on Earth, organisms from bacteria to mammals have evolved a timing system that anticipates these changes. This endogenous timing system, called the circadian clock, orchestrates most aspects of physiology and behavior. The mammalian circadian clock is hierarchically organized.

A central clock localized in the Suprachiasmatic Nucleus (SCN) of the hypothalamus is daily synchronized by the light via the retina-hypothalamus tract and coordinates the peripheral clocks localized in peripheral tissues. The SCN synchronizes most aspects of circadian physiology throughout the life and is required to keep phase coherence between the different peripheral organs.

While new data shows that this circadian clock is disrupted in many human pathologies and during aging, the impact of this disruption on these conditions is it still unclear.

Relapses caused by drug resistance is the major barrier for effective treatment of most solid tumors and hematological malignancies. In acute myeloid leukemia (AML), we showed that mitochondrial adaptation is a critical determinant of resistance to cytarabine (AraC).

We proved that this is associated with an increased availability of respiratory substrates and cofactors, mitochondrial biogenesis and transfer from stromal cells, iron-sulfur cluster biogenesis, BCL2 dependency, and ROS detoxification upon inflammatory and stress responses.

We next demonstrated that the ectonucleotidase CD39 and extracellular ATP promote AraC resistance by enhancing mitochondrial biogenesis and OxPHOS activity through the activation of a cAMP-/ATF4-mediated mitochondrial stress response (MSR). Interestingly, OxPHOS metabolism and MSR are also determinants of the response to IDH- and BCL2-selective inhibitors.

Additionally, our group and others have identified several other markers of relapse-initiating cells (RICs) that are metabolite sensors or transporters such as CD36, SLC7A5 and SLC1A3, which underlined metabolic dialogues between resistant blasts and their microenvironment. This provided access to a broad range of respiratory substrates including fatty acids, glutamine, aspartate, lactate and/or glucose to support the energetic metabolism of RICs. More specifically,

CD36 was positively associated with extramedullary dissemination of leukemic blasts in vivo and in patients. Furthermore, CD36 inhibition reduced metastasis of blasts and prolonged survival of chemotherapy-treated mice. Our ongoing work is highlighting that the role of metabolic and transcriptional trajectories of three distinct RIC populations, diverse tissue metabolomic ecosystems and the impact of ketogenic diet during the course of disease progression.

Alexandre Benmerah, DR2 INSERM, est Biologiste Cellulaire, il a dirigé une équipe de recherche de l’Institut Cochin (2002-2014). Ses travaux sur la poche ciliaire, établissant un lien entre la voie clathrine et le cil primaire, l’ont conduit à s’intéresser à cette antenne cellulaire fascinante et à rejoindre en 2014 l’équipe dirigée par Sophie Saunier à l’Institut Imagine pour y développer des projets centrés sur la néphronophtise, une maladie génétique rénale liée à des dysfonctionnements du cil primaire (ciliopathie). Il y conduit des projets visant à mieux comprendre les fonctions ciliaires, les gènes et l’impact de leurs variants identifiés, dans les mécanismes physiopathologiques lors de la néphronophtise et d’autres ciliopathies.

Alexandre Benmerah a été membre de la section 22 du CNRS et de la CSS1 de l’ANRS. Il est aussi impliqué, dans l’enseignement à l’université Paris-Cité où il dirige le Master 2 “Biologie et Développement Cellulaire”, et dans la médiation scientifique en milieu scolaire (Forum des métiers, Declics).

Passionné de paléoanthropologie, il est également l’auteur d’un blog sur les héritages de nos lointains ancêtres du Néolithique et du Paléolithique.

Au sein de cette équipe Soazig LE LAY dirige un groupe qui s’intéresse aux vésicules extracellulaires du tissu adipeux. Elle s’intéresse depuis 20 ans aux mécanismes moléculaires et cellulaires qui régulent la physiopathologie du tissu adipeux blanc (TAE) et les maladies métaboliques associées à l’obésité (diabète de type II, maladies cardiovasculaires ou stéatohépatite non alcoolique/NASH) dont l’incidence a augmenté de façon spectaculaire au cours des dernières années.

Les vésicules extracellulaires des adipocytes (VE) sont récemment apparus comme des outils puissants pouvant être utilisés comme biomarqueurs de maladies et vecteurs thérapeutiques en clinique. Son thème de recherche s’inscrit dans ce champs émergent dans la perspective d’utiliser les VE des adipocytes pour prévenir les complications cardiométaboliques.

En tant que jeune chercheuse au CNRS, Florence RUGGIERO s’est principalement intéressée à l’analyse des interactions cellule-matrice, des récepteurs du collagène et de la formation des réseaux de la matrice extracellulaire.

En 2001, elle a commencé à diriger son groupe indépendant à l’Institut de chimie des protéines et des protéines (IBCP, Lyon) où elle a apporté des contributions originales dans le domaine de la matrice extracellulaire, des molécules aux organismes. Elle a notamment été pionnière dans l’utilisation du modèle du poisson zèbre pour caractériser la fonction des collagènes dans le développement, la régénération et la maladie.

En 2011, elle a rejoint l’Institut de génomique fonctionnelle de Lyon (IGFL, Ecole Normale Supérieure de Lyon), une structure de recherche de 120 personnes travaillant sur la génomique fonctionnelle, le développement, la physiologie et la biologie évolutive. Son équipe a sans doute acquis une reconnaissance internationale dans le domaine de la biologie matricielle lorsqu’elle s’installe à l’IBCP.

La plupart de ses travaux récents se sont concentrés sur le décodage des relations causales entre la matrice extracellulaire et les événements de signalisation qui régissent la formation des tissus et sur l’examen de leur perturbation possible dans les maladies, ainsi que sur la compréhension de la façon dont les cellules en développement façonnent spatialement et temporellement les matrices contenant du collagène qui sont essentielles pour la formation et l’homéostasie des tissus. Le poisson zèbre est devenu son modèle animal préféré et ses recherches se concentrent désormais sur la réparation de la peau et le rôle de la matrice extracellulaire dans le développement, la réparation et les maladies du système neuromusculosquelettique.